1. Élőhely Elvesztése
Erdőirtás és területátalakítás mezőgazdaságra, erdőgazdálkodásra, urbanizációra csökkenti a jaguaroknak szükséges nagy területeket.
2. Vadászat
A jaguarokat a bundájuk, foguk és testrészekért vadászzák,eket a fekete piacon hagyományos gyógyszer és luxuscikkekért adják el.
3. Emberrel Való Konfliktus
A háziállományt vadászo jaguarokat gyakran megölik bosszúból vagy az emberi biztonság félelmében.
4. Klímaváltozás
A változó éghajlat befolyásolja a jaguar élőhelyét és a vad elérhetőségét, megnehezítve a túlélést és a szaporodást.
5. Genetikai Diverzitás Hiánya
A populációk szétesése és a rokonázás csökkenti a genetikai diverzitást, növelve a betegségérezkenységet és csökkentve az alkalmazkodóképességet.
6. Illegális Kereskedelem
A jaguarokat és testrészeiket illegálisan kereskedik állatkertekhez, magángyűjtőkhöz és hagyományos gyógyszerhez.