A tudósok több megközelítést használnak az organizmusok összehasonlítására és az evolúciós rokonságok megértésére:
1. Morfológiai összehasonlítás
Fizikai jellegzetességek vizsgálata: méret, forma, szín, anatómiai szerkezetek.
2. Összehasonlító anatómia
Bel- és külső anatómia tanulmányozása homolog szerkezetek azonosítására hasonló eredetnel.
3. Embriológia
Korai fejlődési szakaszok összehasonlítása közös ősutódlás gyanúját keltésére.
4. Paleontológia
Foszíliarekordok tanulmányozása a kipusztult organizmusok modern fajokkal való összehasonlítására.
5. Molekuláris biológia és genetika
DNS és RNS szekvenciák elemzése a genetikai rokonság meghatározására és fylogenetikus fák építésére.
6. Ökológiai és viselkedési összehasonlítások
Ökológiai kölcsönhatások, viselkedések, alkalmazkodások tanulmányozása a túlélési stratégiákért.
7. Molekuláris óra
Mutációs ráta használata a fajok elkülönülési idejének becslésére.
8. Hibridizáció és szaporodási kompatibilitás
Keresztezési kísérletek a szaporodási kompatibilitás és evolúciós rokonság értékelésére.
9. Ökológiai nicse modellezés
Modellek használata az ökológiai nicsék előrejelzésére és a potenciális fajelterjedésre.
10. Fylogenetikai analízis
Evolúciós fák rekonstruálása összehasonlító adatokból az ős-utód kapcsolatok megjelenítésére.