Az endém emlősök azok a fajok, amelyek kizárólag egy meghatározott földrajzi területen fordulnak elő, legyen az egy kontinent, ország, sziget vagy specifikus élőhely. Semmore sem fordulnak elő természetesen. Példák az ausztrál koala és a madagaszkári aye-aye. Ezek az emlősök elkülönülésben fejlesztenek ki sajátos tulajdonságokat és kulcsfontosságú elemei a regionális biodiverzitásnak.