Mississippi otthont ad számos biomnak:
- Mérsékelt lombhullató erdei: Az állam északkeleti és keleti részében, tölgyek, dikófák, juhárfák és diófák jellemezik, amelyek télen lehullatják levelüket.
- Fenyőerdei: A déli és nyugati régiókban, hosszúlevelű fenyő, vágófenyő és loblolly fenyő jellemezheti, tűszál-szerű levelekkel.
- Mocsarak: Az egész államon elterjedve, beleértve a bozótokat, lapos mocsarokat és turjánosokat, állóvíz vagy vízben telepedő talajjal.
- Gyepyezek: Az északi és nyugati területeken, szíretek és szavannák, fűvek és gyógynövények dominanciájával.
- Parti síkság: A Mexikói-öböl mentén, alacsony fekvésű terrainy, homokos talaj, partfűvek, dűne-fűvek és palmafák.