Ha transzgénikus gazdálkodási állatok bekerülnek a vadon populációkba, a génanyaguk megváltoztathatja a vad génállományt, potenciálisan csökkentve az alkalmazkodóképességet és a fitnesset. Kórokozókat vagy káros anyagokat is bevihetnek a vadállatokba a kontaktus útján. Ilyen eredmények súlyos negatív hatással lehetnek a természeti ökoszisztémákra.