Amikor egy állat kihal, az ökoszisztéma sokféleképpen érintett lehet:
Biodiverzitás-elvesztés: Minden faj egyedi szerepet játszik, és az elvesztése csökkenti az ökoszisztéma általános változatosságát és stabilitását.
Megzavart éleláncok: A kihalás lyukakat hagy az éleláncokban, hatással legyen a ragadozókra és az állatokra több trófikus szinten.
Populáció-változások: Egy ragadozó elvesztése az állat-populációk robbanásszerű növekedését okozhatja, túllegeltetéshez és erőforrás-versenyhez vezetve.
Élőhely-módosítás: A hódok és elefántok formálják a környezetüket. Elvesztésük drasztikusan megváltoztathatja a mocsarakat, erdőket és más élőhelyeket.
Elveszett ökoszisztéma-szolgáltatások: A beporzás, vízszűrés és talajmegőrzés csökkenhet, ha a kulcsfajok eltűnnek.
Betegség-terjedés: Ragadozók nélkül a betegséget terjesztő állatok terjedhetnek.
Tápanyag-keringés megzavarása: Az ökoszisztémákban tápanyagokat mozgató fajok elhagyása hézagot hagy.
Evolúciós következmények: A kihalás koextinkciókat indíthat el, és megváltoztathat a szelektív nyomás a túlélő fajokon.
Ezek hatásainak súlyossága a faj és az ökológiai szerepétől függ, de bármely elvesztés mély következményekkel járhat a biodiverzitásra.