Puerto Rico otthont ad sokféle állatnak:
- Emlősök: Nyugat-indiai manatí, jamaici gyümölcsdenevér, rizs patkány, házipatkány, vándorpatkány, oposzum, mangusz.
- Madarak: Puerto ricoi papagáj, tody, vireo, fűvönök, pinty, kolibri, pellikaan.
- Hüllők és herczeglakók: Puerto ricoi csúcsos anolis, Mona-szigeti boa, iguánák, geckók, kameleonok, skinek, boa constrictorok, coquí békák, arany coquí békák, kána békák, tenger békák.
- Gerinctelenek: Tarantulák, skorpiók, szentpéterbogarak, tucatlabdák, rákok, garnélek, homárok, tintahalak, polipok.