Ha a kojotok kimerülnének, több ökológiai következmény várható:
- Növekvő rágcsáló populáció: Kojotok nélkül a patkányok és egerek száma növekedne, terménykárosodást és betegség-terjedést okozva.
- Csökkent magv-terjedés: A kojotok székletükkel terjesztik a magvakat; kevesebb kojot csökkentheti a növények regenerációját és diverzitását.
- Ragadozó populációkra hatás: Szarvasok, nyulak, földisquirrelek túlszaporodhatnak, túlzott legeltetéshez és élőhely-feszültséghez vezetve.
- Ökoszisztéma-egészség hatása: A kojotok elvesztése zavarhatja a növény-növényevő dinamikát és csökkentheti a biodiverzitást.
- Nagyobb ragadozók elterjedése: Farkasok és hegyi oroszlánok terjeszthetik a korábbi kojot-területekre, megváltoztatva a ragadozó-ragadozott kapcsolatot.
- Ökológiai szolgáltatások elvesztése: A rágcsáló-ellenőrzés és az ökoszisztéma-egyensúly szolgáltatásai elveszne.
A konkrét hatások a helyi ökoszisztémáktól és a kojotok változó szerepeinktől függenek a különböző élőhelyekben.