A fülülények több fenyegetéssel szembesülnek:
- Élőhelyvesztés: Mocsarak és folyópartok átalakítása mezőgazdaságra és fejlesztésre.
- Vadás és illegális vadászat: Hús, bőr és fogazványokért.
- Ember-vad konfliktus: Termés károsítása és területi agresszió a telepek közelében.
- Betegségek: Szénbacszin és tuberkulózis terjedhet a háziállatok és fülülények között.
- Klimaváltozás: Víz rendelkezésre állás és hőmérséklet változásai hatnak az élőhelyre és az ételre.
- Túlnépesedés: Egyes területeken a sikeres védelem erőforrás-versenyt és konfliktust okozott.
A fülülények védelme élőhely megőrzés, vadás-ellenes intézkedések, betegség-menedzsment és közösségi részvételt igényel.