Az élőhelyek elvesztése és leromlása :A Seychelle-szigeteki hüvelyes denevér az őshonos erdei élőhelyekre támaszkodik a pihenéshez és a táplálkozáshoz. A mezőgazdasági, fakitermelési és fejlesztési célú erdőirtás ezen erdők felaprózódásához és csökkenéséhez vezetett, jelentősen csökkentve ezzel a faj számára elérhető élőhelyet.
Vadászat és csapdázás :A Seychelle-szigeteki hüvelyfarkú denevérre alkalmanként vadásznak táplálékra, vagy használják a hagyományos gyógyászatban. Ezenkívül beszorulhatnak más állatok számára kihelyezett hálókba.
Bevezetett ragadozók :A nem őshonos ragadozók, például a patkányok, macskák és mangúzok betelepítése szintén hozzájárult a Seychelle-szigeteki hüvelyes denevérek hanyatlásához. Ezek a ragadozók a denevéreket, azok fiókáit és az üdülőhelyeiket zsákmányolják.
Kis populációméret és genetikai sebezhetőség :A Seychelle-szigeteki hüvelyes denevér populációja kicsi, és erősen lokalizált, így érzékenyebb az élőhelyek elvesztése, a vadászat és a ragadozás hatásaira. A populáció kis mérete a genetikai diverzitást is korlátozza, növeli a beltenyésztés kockázatát és csökkenti a faj változó környezeti feltételekhez való alkalmazkodási képességét.
Klímaváltozás :A változó éghajlati minták, mint például a megnövekedett hőmérséklet és a megváltozott csapadék, befolyásolhatják a táplálék elérhetőségét és a pihenőhelyeket, tovább súlyosbítva a Seychelle-szigeteki hüvelyes denevérrel szemben támasztott kihívásokat.
Folyamatban vannak a védelmi erőfeszítések a Seychelle-szigeteki hüvelyes denevér és élőhelyének védelme érdekében, beleértve a védett területek létrehozását, az élőhelyek helyreállítását és a ragadozók elleni védekezést. A faj azonban továbbra is kritikusan veszélyeztetett, és folyamatos megfigyelést és védelmi beavatkozást igényel hosszú távú túlélése érdekében.