A hawaii hörcsösdenevérek a települések miatt bekövetkező élőhely-elvesztés, az éghajlatváltozás, a betegségek, az emberi zavarás, a kis és elszigetelt populációk, a bejövetel fajokkal való verseny, valamint a bejövetel ragadókkal való ragadozás miatt veszélyeztetettek. A védelem magában foglalja az élőhely-helyreállítást, a tudatosság növelését és a bejövetel fajok kezelését.