Az Antarktiszon a kiterjedt körülmények miatt viszonylag kevés faj él, és kevés van globálisan kritikusan veszélyeztetettnek minősítve. Azonban néhány antarktiszi faj van felsorolva sebezhetőnek vagy közel veszélyeztetettnek a természervédelmi szervezetek által. Példák: a császárpingvin (Közel veszélyeztetett), az antarktiszi kékbálna (Veszélyeztetett) és a Ross-tengeri fogashal (Sérülékeny). A klímaváltozás, a tengerjég elvesztése és a túlhalászat a fő aggodalomok. A pontos szám a használt szervezet és kritériumok szerint változik.