A ma már csak az állatkertekben előforduló veszélyeztetett fajok gyakran kisméretű, elszigetelt populációkból származnak, amelyek számát kritikusan alacsonyra csökkentették különböző tényezők, például az élőhelyek elvesztése, a vadászat és a túlzott kizsákmányolás miatt. Ha ezeket a fajokat megőrzési és szaporítási célból állatkertbe viszik, akkor a vadon élő populációban meglévő genetikai sokféleségnek csak egy töredékét hordozhatják magukban.
Ahogy ezek a fajok fogságban szaporodnak, a korlátozott genetikai variáció tovább koncentrálódik, ami az allélok elvesztéséhez és a genetikai diverzitás csökkenéséhez vezet. Ez idővel káros hatással lehet a faj változó környezeti feltételekhez való alkalmazkodási képességére, valamint a betegségekre való fokozott fogékonyságra, így sebezhetőbbé válik a kihalás ellen.
Az alapító hatás hatásainak mérséklése és a genetikai sokféleség megőrzése érdekében az állatkertekben a természetvédelmi programok gyakran olyan stratégiákat hajtanak végre, mint a szelektív tenyésztés, a populációkezelés és a genetikai mentés. Ezen intézkedések célja az új genetikai anyag bejuttatása a fogságban tartott populációkba, a genetikai sokféleség fenntartása, valamint a beltenyésztési depresszió és az alacsony genetikai variációból eredő egyéb genetikai problémák kockázatának csökkentése.