A guppy speciális lélegzőszervel, a zúzmóval lélegzik, amely a fej oldalaín, a szemek mögött helyezkedik el. A zúzmók vékony szálakból állnak, amelyek kicsi erekkel vannak fedve. Amikor a guppy száján keresztül veszi be a vizet, az áthalad a zúzmókon, ahol az oxigén beáramlik a vérbe, a szén-dioxid pedig a vízbe szabadul. Az operkulum (zúzmócsont) nyitva-zárva pumpálja a vizet.