14 denevérfaj őshonos Missouriban, kettő veszélyeztetett. Mivel mind rovarokat evés, hatalmas mennyiségben csökkentik az éjszakai rovarterhelést – kulcsszereplők az ökoszisztémában.
Barna denevérek
A legismertebb kettő, amiket otthonokban/épületekben találhatunk: kis barna denevér (Myotis lucifugus) és nagy barna denevér (Eptesicus fuscus). A többiek barlangokat/fákat preferálnak. Mindketten barna, sötétebb szárnyakkal. Kis barna: 11–14 cm testhossz. Nagy barna: 14–20 cm.
Veszélyeztetett denevérek
Három faj az amerikai veszélyeztetett listán: Indiana (Myotis sodalis), Ozark nagyfülű (Corynorhinus townsendii ingens), szürke (Myotis grisescens). A szürke denevér egész évben barlangokban él. Az Indiana denevér nyáron az USA keleti felében (beleértve Missouri-t), télen néhány kiválasztott barlangban óriási számokban télvál. Az Ozark nagyfülű denevér – név szerint – hatalmas füllel rendelkezik. A "National Geographic" szerint valószínűleg már nem él Missouri barlangaiban. Mindhárom fagynak a barlangok rombolása (kutatók, bányászok stb.) miatt.
Vándorló denevérek
Néhány faj csak évszakosan van Missouriban. Az estvédenevér (Nycticeius humeralis) kis, vörösesbarna, néha épületekben, télen máshol (télvándorlás helye kevésbé ismert). A barna szürkehajú denevér (Lasiurus cinereus) a legnagyobb Missouriban, télen Mexikóba, Dél-Amerikába, déli Kaliforniába vándorol. A vörös denevér (Lasiurus borealis) (élénk vörös/narancs – tompa cégla/kasztanbarna) is vándorol télen, de néhány a déli részen maradhat.
Egyéb fajok
Ritka, közepes északi hosszúfülű (Myotis septentrionalis), keleti pipisztrell (Pipistrellus subflavus) – legkisebb keleten. Ezüsthajú denevér (Lasionycteris noctivagans) – fekete, ezüst szélű szőrrel. Kislábú denevér (Myotis leibii) – barna, fekete maszkkal. Rafinesque nagyfülű – az Ozark nagyfülű rokona, veszélyeztetett. Brasil szárazfarkú denevér (Tadarida brasiliensis) is előfordul.