Nem, nem minden német juhásznak barna szeme van.
Bár a barna szemszín a leggyakoribb a német juhászoknál, előfordulhatnak más színek is:
- Borostyán szeme: Meleg, vörösesbarna szín.
- Kék szeme: Ritkább, de lehetséges.
- Heterochromia (kétféle színű szeme): Két különböző színű szeme. Ritka, de előfordulhat német juhásznál.
A német juhász szemszíne a színezett keringben lévő melanin mennyiségétől függ. Minél több melanin, annál sötétebb a szeme.