A szürke fókáknak néhány természeti ellenségük van, de a legjelentősebb az ember.
Természeti ragadozók:
- Fehér cápa: Fenyegetés a találkozó területen, elsőszerűen a kiskutyák és fiatal fókák számára.
- Orcák (kaszkó): Ismertek fókavadászon, de nem gyakori fenyegetés a felnőtt szürke fókákra.
- Jégmedvék: Az Arktisban fenyegetést jelenthetnek a szürke fókákra.
Emberi hatások:
- Horgászfelszerelés akadályozás: Sérülést vagy halált okozhat.
- Élőhely elvesztése és zavarás: A partfejlesztés hatással van a tenyésztési kolóniákra és a vadászi terepre.
- Vadászat és furtászat: Történelmileg csökkentették a populációkat bizonyos területeken.
Egyéb tényezők: betegségek és éghajlatváltozás. Összességében, bár a szürke fókáknak vannak természeti ragadozói, a legjelentősebb fenyegetések emberi eredetűek.