A csakrákkal kapcsolatos tudományos bizonyítékok és kutatások korlátozottak, és a csakrák megértése elsősorban a hagyományos gyakorlatok, a szellemi hiedelmek és a személyes tapasztalatok körül forog, nem pedig az empirikus tudományos validáció körül. Ennek eredményeként a modern tudományban nem ismerik el vagy tanulmányozzák.
Mint ilyen, a csakrák fogalma általában az emberekre korlátozódik, és nincs olyan jelentős tudományos bizonyíték vagy információ, amely az állatokban létezik a csakrák létezésére. Ezért a csakrák fogalmát általában az emberi energiarendszerekkel és a szellemi gyakorlatokkal társítják.