Genetikai betegségek és betegek
Inbreedingnél (rokonok párosítása) a recesszív gének (egyetlen defekt másolat) összeflussanak. Ha a következő generáció is rokonnal párosul ugyanazzal a génnel -> a betegség kifejeződik a kölykökben (Imperial College London kutatók). Gyakori: epilepszia, csípő dysplasia, glaucoma. Sükettség, vakság, egyéb állapotok is.
Mélyülő gencmedence
Nem mindig szándékos. Kis kiindulási állomány -> gencmedence csökkenés. Pl. basenji: 1987 előtt 12 eredeti kutya (7 kan, 5 szuka) -> 3-4 évtized alatt elmélyedett. 1980-as években afrikai kutyák behozatal a frissítéshez. AKC "fajta javítása" standardja is vezethet ehhez: egy kiváló kan/szuka túl sok kölyököt termel -> a "top" gencmedence csökken, a recesszív hibás gének dominánssá válnak.
Fejlődési rendellenességek
Inbreeding befolyásolja a gének mutációját a magzati fejlődés alatt. Extra/hiányzó végtagok,סר organok. Emelt újszülötti/ magzati halálozás, súlyosabb rendellenességek (Bretaigne Jones, Royal Canin).