A filovírusok szálas, burkolatos, nem szegmentált, egyszeres szálú, negatív értelekű RNS vírusok. Elektronmikroszkóp alól hosszú, vékony, szálas részecskének tűnnek, helicális nukleokapsziddal, fehérjemátrixszal és külső burkolattal, glikoproteín csúcsokkal. Ezek a csúcsok kötődnek a sejtfelületi receptorokhoz a gazdasejtekbe való behatoláshoz. A filovírusok hossza 80–1400 nm, átmérőjük 80–100 nm.