A manta-teknősök testnyelvvel, szúnyog-jelekkel, ugrással, érintéssel, színmintákkal és légi kijelentésekkel kommunikálnak. Nagy mellszúnyogaik és testmozgásaik agressziót vagy kíváncsiságot fejeznek ki. Szúnyogaikat remegtenek vagy villogtatnak figyelmeztető jelként. Az ugrás pártvonzó vagy figyelmeztető funkciót tölthet be. Az érintés és az egyedi színminták segítenek az egyedek azonosításában és a társadalmi kohézió fenntartásában. Légi kijelentések a párzás és idegen tárgyakkal való találkozáskor történnek.