A beágyazás (nesting) akkor következik be, ha egy ciklusstruktúrát egy másikba helyeznek. Mind a határozott, mind a határozatlan ciklusok beágyazhatók. Beágyazott határozott ciklusok esetén a belső ciklus az összes iterációját végrehajtja a külső ciklus minden egyes iterációjához. Beágyazott határozatlan ciklusok esetén bármelyik ciklus futhat végtelen ideig. A határozott és határozatlan ciklusok beágyazása a határozatlan ciklusok szabályait követi.
A beágyazott ciklusok lehetővé teszik a programozók számára, hogy több szekvencián vagy adatstruktúrán iteráljanak, és kombinált feltételek alapján bonyolult műveleteket hajtsanak végre.