A madarak az Aves osztályba tartoznak , melyet tollak, csőrök és szárnyak jellemeznek, míg a denevérek a Chiroptera rendbe tartoznak, az emlősök osztályán belül . A denevérek az egyetlen emlősök, amelyek motoros repüléssel rendelkeznek.
A denevéreknek és a madaraknak közös ősei vannak Szinapszidnak nevezett, amely körülbelül 300 millió évvel ezelőtt létezett. Ettől a közös őstől két ág vált el:a szinapszidok, amelyek emlősökké fejlődtek, és a szauropszidák, amelyekből hüllők és madarak születtek.
Bár lehet, hogy közös őseik voltak, a denevérek és a madarak között jelentős különbségek alakultak ki anatómiájukban, fiziológiájukban és viselkedésükben évmilliók során.