A barna pellikánok ökológiailag értékesek több szempontból:
Ökológiai szerepe: Halaket esznek, fenntartva a rovó-előd egyensúlyát a tenger ökoszisztémáiban.
Populációs indikátorok: Csúcspredátorokként egészségük és populációjuk tükrözi a tenger környezetének állapotát.
Csontvállalók: Elfejezhetnek holt halakat, eltávolítva a szerves anyagot a vizekből.
Tápanyag-keringés: Etetés és szekrényzés útján eloszlatják a tápanyagokat, támogatva a fitoplankton növekedését.
Biodiverzitás indikátorok: Jelenlétük és egészségük tükrözi más tengeri fajok sokféleségét.
Kulturális jelentőség: Szimbólumai a partrendszereknek sok régióban.
Esztétika: Fenséges repülésük és merülési viselkedésük szépíti a partvidékeket.