A kanálcsőrű réce mindennövő és változatos étrenddel rendelkezik, amely széles körű növényi és állati anyagot foglal magában. Az étrendjük elsősorban kis vízi gerincteleneket tartalmaz, mint rovarak, féregek, rákok és moluskok. Emellett kis halakat, algákat, magvak és növényi anyagot is fogyasztanak a sekély vizekben. A kanálcsőrű réce egyedi kanál alakú csőrijét használja az étel szűrésére és szitálására a vízből. A fészekelési időszakban az étrendjük több rovarat és kis halat tartalmazhat, a téli hónapokban pedig jobban támaszkodnak a növényi anyagokra és magvakra.