Papagáj feber
A Chlamydia psittaci, egy baktérium-szerű szervezet, okozza a papagáj febert (psittacosis), ami a görbe csőrű madarakat, mint papagájkat és undorítókat érinti. Az Egyesült Államokban a chlamydiosis a pulykák és galambok között probléma, a csirkék pedig ellenállóbbak. A baktérium terjedése a fertőzött széklet porinak beinhalásával és a hordozó madarak által történik. Az érintett madarak hasmenést, köhögést és szem-/orrfolyadékot mutatnak. A fertőzött pulykáknál a tojástermelés csökken. A kezelés széles spektrumú antibiotikumot igényel a madaraknál, és tetracyklint az embereknél.
Salmonella
Az legtöbb állat és az ember is érzékeny a salmonella fertőzésre. A salmonella baktérium széklettel szennyezett étel evéssel terjed. A fertőzött csirkék továbbadhatják a fertőzést a tojásaikon keresztül, kockázatot jelentve az embernek a nyers tojás fogyasztásakor. Egy fajta, a salmonella Arizona leggyakrabban hüllőkben és madarakban fordul elő. A fertőzött baromfiak gyengeséget, anorexiát és remegést mutatnak. A pulyka, csirke és kanár furdalásokban a halandóság akár 60%-ot is elérheti. A legtöbb salmonella fajtta több hónapig túlél a talajban, a takarmányban és a vízben.
Madár tuberkulózis
A Mycobacterium avium baktérium okozza a madár tuberkulózist, szorosan kapcsolódik a tehén tuberkulózis baktériumához, ami az embert érinti. A legtöbb mikobaktérium fertőzéstől eltérően az M. avium rendkívül ellenálló az antibiotikumoknak; a betegett limfa csomók sebészeti eltávolítása az egyetlen módja a betegség megszüntetésének. Ezért a fertőzött baromficsorok depopulációja a legköltséghatékonyabb opció.
Botulizmus
A botulizmus a madarak párálizáló és gyakran halályos betegsége, amit a Clostridium botulinum baktérium által termelt toxin bevétele okoz. A Nagy-tavak vidéken a sirályok és a nordai sólymok rendszeres tömeghalálai gyakoriak. A botulizmus spórák formájában létezik, gyakori az USA tavainak és mocsarainak partvidékén. Egyes környezeti tényezők, mint a vízszint ingadozása, a romlott növényzet és a magas hőmérséklet hozzájárulnak a botulizmus kitöréséhez.
Vörösbegy (Erysipelas)
Az Erysipelothrix insidiosa baktérium okozza a vörösbegy beteget csirkék, kacsák, lúdak és pulykáknál. A vörösbegy leggyakrabban fiatal hím pulykáknál fordul elő az őszi és téli hónapokban. Ezek a baktériumok hosszú ideig élnek a talajban, így a táiértés gyakori. A tömeg, a nedves idő és a rossz szanitáció növeli a kitörés esélyét. A fertőzött madarak láthatóan betegek: általános gyengeség, étvágytalanság, sárga vagy zöldes hasmenés.