A komodovaranok az erdőkivágás és fejlesztés miatt bekövetkező élőhely-elvesztés, az illegális vadászat és farkasvadászat, az elszigetelt populációk inbreedingje, valamint az éghajlatváltozás, ami a fészekelő partokat és az ételrendelkezésre állást érinti, miatt veszélyeztetettek.