A juhászkutya a Chordata félébe tartozik. A chordák olyan állatok, amelyek nemocordát, háti idegköteget és faríngealis táskákat rendelkeznek az embryonalis fejlődés során. A juhászkutyák, a Canis nemzetséghez tartozva, a Vertebrata alfélébe sorolhatók, mert gerincük van.