Vadászat és orvvadászat: Az Appennini zergét évszázadok óta vadászták húsáért, szőréért és agancsáért. A jogi védelem ellenére az illegális vadászat és orvvadászat továbbra is előfordul, és jelentős veszélyt jelent a zergeállományra.
Verseny a hazai haszonállatokkal: A háziállatok, például a juhok és a kecskék versenyeznek a zergével az élelemért és az erőforrásokért. Ez a versengés csökkentheti a zerge túlélési és szaporodási képességét, különösen zord télen, amikor kevés a táplálék.
Betegség: Az Appennini zerge érzékeny különböző betegségekre, beleértve a tüdőférget, a ragadós száj- és körömfájást és a brucellózist. Ezek a betegségek gyorsan terjedhetnek a zergepopuláció körében, és jelentős halálozást okozhatnak.
Klímaváltozás: Az éghajlatváltozás miatt az Appennini zerge élőhelye gyorsan megváltozik. Az emelkedő hőmérséklet és a csapadékmintázatok változása hatással van a növényzetre és a hótakaróra, megnehezítve a zergék számára, hogy élelmet és menedéket találjanak.