A ginkgo biloba fa kipusztulása jelentősebb változásokat okozna az ökoszisztémájában.
- Biodiverzitás-veszteség: az egyetlen élő faj a nemzetségében, az eltűnése egyedi genetikai ág elvesztését jelentené.
- Ételháló hatás: a leveleit és magvait evő rovarok, madarak, emlősök elveszítenék egy táplálékforrást.
- Élőhely-alteráció: a ginkgo fák fészekhelyet és menedéket adnak; elvesztésük csökkenti az élőhely minőségét.
- Kapcsolatok megszakadása: porzás, magvándorlás, tápanyag-ciklus hatása.
- Dinamika-váltás: talaj-összetétel, mikroklíma, fajelterjedés változásai.