Az akvárium tengeri halak bármilyen számú fertőzésre hajlamosak. Néhány fertőzés a szemeket érintheti, látás zavarokat, vakítást és halált okozva. Sok optikai rendellenesség kezelhető a hal elkülönítésével egy külön akváriumba és gyógyszeres öblítések (medicated dips) használatával. Ugyanakkor néhány szemprobléma komolyabb betegségek jele lehet.
Exophthalmia (Kilógó szem / Pop-eye)
Az exophthalmia, vagy "kilógó szem betegség", a szemek mögötti folyadék felhalmozódásával jellemezhető. Ez a betegség egyre jobbra tolja a szemgolyókat a szemüregeikből. Kezelés nélkül a szemgolyók lecsatolódnak, és a hal elveszíti a látását. Az oka lehet A-vitamin hiány, rossz vízminőség, sérülés vagy bakteriális fertőzés. Vannak kezelési módszerek. Először a vízminőséget kell ellenőrizni tesztkészlettel, hogy vannak-e emelt nitrát vagy ammónia szintek. Ez különösen fontos, ha több hal is tüneteket mutat. Ha ez az eset, az Aquarium Life javasolja a víz 30%-ának eltávolítását és cseréjét 4–5 napig, hogy javuljon-e az állapot. Egy másik módszer: a hal áttelepítése izolációs tankba, és 1 evőkanál Epsom-só (bittermagnésia) minden 5 gallon (19 liter) vízhez. Az Epsom-só segít kivonni a felesleges folyadékot asebből. Egy Maracyn nevű antibiotikum is használható, ha a fertőzés bakteriális. Az A-vitamin hozzáadása az étrendhez is gyakran megoldja a problémát.
Tuberkulózis
A tuberkulózis a Mycobacterium piscium baktérium okozta betegség. Sötét foltokkal jellemezhető a szemeken és a testen. A halak élschuppenvesztést, elváltozást és vaskozatot is tapasztalhatnak. Későbbi szakaszban a test megferdülhet és deformálódhat. Az oka a rossz vízminőség és a zsúfolt tartás. B6-vitamin és Kanamycin használható a kezelésre, de a sikerarány alacsony. A halat emberien meg kell ölnie a közösség többi tagjának megfertőződésének megelőzése érdekében.
Tengeri Ich (Fehér foltos betegség)
A tengeri ich gyakori betegség a sós vízi halaknál. A Cryptocaryon irritans parazita okozza. A betegeknek gyakran homályos a szeme, étvágytalanságuk és Sérült szirénáik van. A testüket fehér pontok borítják. A betegség okozhatja a rossz vízminőség, a túlzsúfoltság és a magas ammónia szint, de előfordulhat, ha fertőzött halat adnak a tankhoz. Az ich kezelhető réz oldattal (copper solution). Fontos eltávolítani a rézzel kezelt állatásokat, mert az ásványanyag megölheti a ménkű nélküli halakat és korallokat a korall tankban. A betegség kezelhető gyógyszeres formálindippel (medicated formalin dip) is.