Bár a fekete kaimánok a környezetükben csúcsragadozók, van néhány ragadozójuk, bár kevés:
- Nagyobb kaimánok: Felnőtt fekete kaimánok prédái lehetnek a nagyobb fajtagénsek.
- Jaguarok: Ismert, hogy esetenként megvadásszák a felnőtt fekete kaimánokat.
- Anakondák: Nagy zöld anakondák képesek megölni és elfogyasztani a felnőtt fekete kaimánokat.
- Emberek: Bőrük és húsuk miatt furtosítás áldozatai.
A felnőtt fekete kaimánok ragadozása viszonylag ritka, mivel erősek és jól felszerelve a védelmére.