A Kanchenjunga-hegység biodiverzitása gazdag. Az ott élő állatok:
Emlősök: Hópardusz, himalájai fekete medve, kék bárány, himalájai tahr, vörös panda, muszusz szarvas.
Madarak: Himalájai monál, vérfazánt, hó partizán, lámmergeier, himalájai griffon sas, arany sas.
Hüllők: Himalájai vipera, királykígyó, tibeti félégy gyík.
Herpetok: Himalájai tritó, tibeti béka.
Gerinctelenek: Góliát bogár, himalájai méh, pókpók, százlábúak, ezerlábúak.
Az előfordulás és elterjedés a tengerszint feletti magasságtól, az élőhelytől és az évszakktól függ.