Változatos étrend
A zooflagelláták egysejtű heterotrófok, ami azt jelenti, hogy más szervezeteket fogyasztanak.
Etetési stratégiák
Szafrotrof: Bomló anyagot esznek.
Parazita: Élnek a gazdában (pl. Trypanosoma, Giardia).
Szimbiotikus: Segítenek a cellulóz emésztésében hernyókban vagy szarvasmarhában.
Mixotróf: Az Euglena képes fotoszintézisre és etetésre is.
Kulcsfontosságú szerepet játszanak az ökoszisztémákban bomlásozó, parazita és szimbiontként.