Számos különféle specifikációs modell létezik, amelyek mindegyike leírja az új fajok felmerülésének más módját. A specifikáció leggyakoribb modelljét allopatrikus specifikációnak nevezzük , ami akkor fordul elő, amikor ugyanazon faj két populációja földrajzilag izolálódik egymástól, és önállóan fejlődnek, végül két különálló fajsá válnak. Az allopatrikus specifikációt különféle tényezők okozhatják, mint például a hegység kialakulása, a tó kiszáradása, vagy a szárazföldi tömegek elválasztása a folyóval vagy az óceánon.
A specifikáció másik modelljét szimpatrikus specifikációnak nevezzük , amely akkor fordul elő, amikor ugyanazon faj két populációja függetlenül fejlődik ugyanabban a földrajzi helyen, anélkül, hogy fizikai akadályok lenne közöttük. Szimpatikus specifikáció előfordulhat különféle mechanizmusok, például az ugyanazon populáció különböző tulajdonságaira gyakorolt természetes szelekció, a reproduktív izoláció fejlődése vagy a poliploidia előfordulása miatt, amelyben a szervezetnek több mint két teljes kromoszómakészlete van.
A specifikáció folyamatát összetett lehet, és a tudósok továbbra is vizsgálják és megvitatják az új fajok kialakulásához vezető specifikus mechanizmusokat.