Potenciális hátrányok:
• Előre nem jelezhető hosszú távú hatások: Egészségügyi problémák vagy rendellenességek jelentkezhetnek idővel.
• Génszennyezés: Módosított állatok kereszthezhetnek vadon élő populációkkal, megzavarva az ökoszisztémákat.
• Állatjóléti aggályok: A módosítások károsíthatják a viselkedést, az instinctusokat vagy a jólétet.
• Etikai megfontolások: Sokan ellenzik az élőlények módosítását emberi célokra.
• Szabályozási kihívások: Komplex keretrendszerek kellenek a biztonság és felelős használat biztosításához.
• Fogyasztói elfogadás: A közvélemény szkepticizmusa korlátozhatja a piaci potenciált.
• Technológiai függőség: Speciális szakértelem korlátozhatja a hozzáférhetőséget, főleg a fejlődő régiókban.
• Géniai diverzitás vesztése: Módosított tulajdonságok csökkenthetik a faj rugalmasságát.
• Nem szándékolt következmények: Egy gén megváltoztatása előre nem látható negatív hatásokat válthat ki.