A kojotok alkalmista ragadozók és csontvárak, de ők is greater állatok prédái. Íme néhányuk fő ragadozói:
Nagyobb ragadozók:
* Farkasok: A farkasok a kojotok fő természeti ragadozói, különösen ahol az elterjedésük átfedésben van.
* Hegyi oroszlánok: A hegyi oroszlánok (pumák) erőteljes ragadozók, képesek kojotokat megölni, főleg a hegségekben.
* Medvék: Bár nem olyan gyakoriak, a medvék is vadászhatnak kojotokat, ahol bőségben vannak.
Egyéb ragadozók:
* Vadmacskák: A vadmacskák kisebbek a kojotoknál, de megölhetik őket, főleg a fiatal vagy gyengült egyedeket.
* Nagyobb ragadozó madarak: Sasok, bagolyok, rétik néha vadászhatnak kojotokat, különösen a fiatalokat.
* Egyéb kojotok: A verseny heves lehet a kojotocsordák között, és megölhetik egymást, főleg a területért vagy erőforrásokért.
Egyéb fenyegetések:
* Emberi tevékenységek: Vadászat, fogás, élőhelyelvesztés jelentősen hatással lehet a kojot populációkra.
* Betegségek és paraziták: A kojotok érzékenyek lehetnek betegségekre és parazitákra, ami gyengítheti őket, és sebezhetőbbé teszi a ragadozók előtt.
Fontos megjegyezni, hogy a valószínűsége, hogy egy kojotot egy konkrét ragadozó megessen, nagyban változik a helytől, a ragadozott rendelkezésre állásától és a ragadozó népsűrűségétől függően.