Élőhelyelvesztés
Természeti élőhelyének pusztítása és töredeződése, elsősorban emberi tevékenységek (mezőgazdaság, marhatenyésztés, szójatejes gazdálkodás) miatt.
Vadászat és illegális kereskedelem
A farkas agárat gyakran vadásszák a bőréért, vagy félelemből, hogy tenyésztetményt ragad, és illegálisan háziállatként is kereskednek vele.
Verseny házi kutyákkal
A házi kutyák átadhatnak betegségeket és parazitákat, és versenyeznek az ételért és a területért.
Útépítés
Az utak töredezhetik a farkas agár élőhelyét, nehézzé vagy lehetetlenné téve az egyedek mozgását és párkeresését.
Bűnözés (tarka hit)
Vadásszák a téves hiedelem miatt, hogy a farkuk szőre csodatevő vagy mágikus erővel bízik.