1. Élőhely-elvesztés
A legfontosabb tényező a mexikói farkas veszélyeztetettsége az élőhely-elvesztés. Ez nagyrészt a természetes élőhelyek mezőgazdasági és városi területekké alakításából adódik. Eredményként a mexikói farkasok elvesztették a természetes prédáikhoz és a megfelelő fészekelő helyekhez való hozzáférést.
2. Vadászat és csapdázás
Történelmileg a mexikói farkasokat bőrükért és ragadozó-ellenőrzés céljából vadászták és fogták. Ez a különbségtelen gyilkosság tovább csökkentette a populációjukat.
3. Hibridizáció
A mexikói farkasok rokonok a kojótokkal, és a két faj közötti kereszteződés dokumentált. A hibridizáció vezethet a mexikói farkas genetikai integritásának elmosódásához és az उनIQUE alkalmazkodások elvesztéséhez, amelyek elengedhetetlenek a természetes környezetükben való túléléshez.