A Hypohippus valószínűleg a verseny és a változó éghajlat miatt halt ki. Újabb növényevők, mint a szarvasok és antilopok, jobban alkalmazkodtak a megjelenő gyepesületekhez, kikövetkeztették a Hypohippust az ételért. Ahogy az erdők place gyepesületekké váltak, a Hypohippus erdőhöz alkalmazkodott fogai és kövényei kevésbé előnyössek lettek, hozzájárulva a hanyatláshoz.