A San Jose misszió (Mission Santa Clara) konkrét állatjegyzékei ritkák, de a spanyol kaliforniai missziók általában tartottak:
Tenyesztett állatok
* Szarvasmarha húsért, tejért, bőrért, munkára.
* Juhok gyapjúért.
* Lovak szállításra és munkára.
* Sertések, kecskék, csirkék húsért és tojásért.
Egyéb állatok
* Kutyák őrzésre és vadászdásra.
* Macskák rágcsálóellenőrzésre.
* Szamár terhek szállítására.
A pontos állatállomány a misszió erőforrásaitól és igényeitől füst. Az őslakosok is használták a helyi vadállatokat ételre és szellemi célokra.