Az emlősöket három fő csoportba sorolják a szaporodási módjuk alapján:
Kloákás emlősök (Monotremák)
Tojást tenni képes emlősök, mint a kacsorrú emlős (platypus) és a tüskés emlősök (echidnák). Ez a legősibb emlős-csoport.
Zsák emlősök (Marsupiálisok)
Korai fejlettségi stádiumban szülnek, a kisállatok ezután a anya hasán lévő zsákban (marsupium) fejeződik be a fejlődésük. Ilyenek a kenguruk, koalák és oposzumok.
Méhelyes emlősök (Placentálisok)
Teljes értékben kifejlett, élő szülöttet hoznak világra. A méhely (placenta) biztosítja a magzat táplálék- és oxigénellátását a terhesség alatt. Ide tartoznak az emberek, denevérek, bálnák, egerek és az emlősök túlnyomó többsége.