A felnőtt szürke bálnáknak nagyon kevés természeti ragadozójuk van a nagy méretük miatt.
Az orkák a legjelentősebb fenyegetés, főleg a kölykökre és ifjukra. A jégmedvék támadhatnak mélyen lévő partvizekben, és a nagy cápaformák ritkán jelentenek fenyegetést. Az emberi tevékenység, beleértve a horgászati felszerelésbe akadást, a hajózási ütközéseket és a szennyezést, szintén veszélyezteti a szürke bálnákat.
Ezek a fenyegetések ritkák, és nem hatnak signifikánsan a teljes populációra.