A kojotok, mint más farkasfélék, heterodont fogazattal rendelkeznek, azaz különböző típusú fogai vannak különböző funkciókhoz:
Szekciófogak: Ezek a kis, éles fogak a száj élén, a megharapáshoz és a szépítéshez.
Eckfogak: Ezek a hosszú, hegyes fogak a szeckciófogak mögött. Ezek a legerősebb fogak, a predák megrágásához és megfogásához.
Előörömfogak: Ezek az eckfogak mögötti fogak, éles csppekkel a darálásra és örlésre.
Örmfogak: Ezek a lapos, széles fogak a száj hátulján, a törléshez és örléshez.
A kojotok összesen 42 foguk van:
6 szeckciófog az üstel és alsó állkapocson minden oldalon (12 összesen)
2 eckfog az üstel és alsó állkapocson minden oldalon (4 összesen)
8 előörömfog (4 minden oldalon, felső és alsó)
6 örmfog (3 minden oldalon, felső és alsó)
Ezek a specializált fogak lehetővé teszik a kojotok hatékony vadászatát és fogyasztását a különböző prédáktól, a kis rágcsálóktól a nagyobb állatokig, mint a szarvasok.