Néhány potenciálisan halálos kutya feregese nem található a székletmintákban, bár a székletminták továbbra is része legyenek a kutyá rendszeres ellenőrzésének. Sok kutya feregese más szervekben él, nem az emésztőrendszerben. Amikor a feregesek tojásokat dobnak, azok gyakran a vérbe, könnybe vagy a vizeletbe kerülnek, nem a székletbe, a "Dog Owner's Home Veterinary Handbook" szerint.
Szívi Feregesek
A szívi feregesek halált okozhatnak a kutyáknak. A szívi feregesek a kutya vérkeringésében utaznak, és végül a tüdőkbe, majd a szívbe kerülnek, az American Heartworm Society szerint. Csak vérvizsgálattal lehet kimutatni a felnőtt vagy juvenil (mikrofilaria) szívi feregeseket. A székletvizsgálat nem működik. A mikrofilaria elleni gyógyszer nem öli meg a felnőtt szívi feregeseket, és a felnőtt szívi feregesek elleni gyógyszer sem öli meg a mikrofilariakat. Ezért a kutyák vérvizsgálatot kapnak a felnőtt szívi feregesek ellen, mielőtt mikrofilaria-megelőzési programra kerülnek.
Vese Feregesek
Több fajta apró feregese fertőzheti a kutya veséit. A leggyakoribbak: Capillaria plica és Dioctophyma renale, a Bari Spielman állitorvos szerint (PetPlace.com). A kutyák fertőződnek, ha feregesekkel fertőzött lombfejeket, béka vagy halakat esznek. Mivel a feregesek a vizeletkimeleitő rendszerben élnek, a tojásaikat a kutya vizeletbe adják, nem a székletbe. A tojások a vizeletben jelentkeznek, de a székletben nem.
Szemfereg (Eyeworm)
A Thelazia californiensis egy 1-2 cm hosszú feregese, ami a kutya könnycsatornáiban él. A tojásait a kutyája könnybe adja, hogy a repülő rovarok (pl. légy) elfogyasszák, így a tojásoknak nincs esélyük a székletbe kerülésre. A tojások a rovarban kelnek ki és lárvává nőnek. Amikor a rovar egy másik kutya arcáról iszik, a lárvák az szemhez gördülnek. Ezek a feregesek krónikus konjunktivitist vagy más szemgyulladást okozhatnak. A diagnosztika nehéz, de a kutyája könnyének vizsgálatával meg kellene mutatnia a feregese tojásait.
Szeplőfereg (Whipworm)
Egy feregcsalád, a szeplőfereg, tojásokat helyez a kutya székletében, de ezek a tojások rendkívül nehezen találhatók meg, még tapasztalt állatorvosok számára is, a "Dog Owner's Home Veterinary Handbook" szerint. Több székletminta vizsgálata sem mutathat tojásokat. A szeplőfereg diagnosztizálásához az állatorvosok gyakran kihagyják a székletvizsgálatot, és a karakterisztikus hasmenést vizsgálják, amit okoznak. A székletet nyálkahártya és vér borítja. Kezeletlen kutyák elveszítik a súlyukat és véralvadásosakká válnak. Számos receptes férgetelenítő gyógyszer öli meg a kutyák szeplőferegét és más feregeseket.