A gombás fertőzések egy vagy több gomba-faj bejutását jelentik a testbe. A gombák a felületeken, a levegőben, a talajban vagy a madártrágyában élnek. A kutyák emésztéssel, felszívódással vagy egyszerűen a körüli levegő belehajtásával szívják be a különféle gombákat.
Aszpergillózis
Az aszpergillózis az Aspergillus gomba okozza, ami a hullaleveleken, komposztkupákban vagy más rombolódó növényzetben nő. Ez egy gombás fertőzés, ami elsősorban fiatal, hosszú orrú fajtáknál fordul elő. Főleg a kutya orrkamráit érinti, de gyakran okoz léziókat több szerven is, beleértve a szemet. Tünetek: orrfolyás, fájdalom, tüsszentés, lelassulás. Fel nem derítve vagy kezeletlenül az aszpergillózis a koponyába és a szem körüli puha szövetekbe nő be.
Blasztozikózis
A Blastomyces dermatitidis gomba pesszemként él a folyók völgyeiben és vízkörösvéken található homokos, savas talajban. A blasztozikózis a legnagyobb kockázatot a 2-4 éves, nem kastraolt, vadászi vagy sportfajta himeknél jelentik, leginkább a 23-34 kg tömegkategóriában, nyáron és őszen. Ha a szemet is befogja, a szemgolyókon növedék alakul ki, ami glaucomát, retinadiszlocációt és akár vakságot okoz.
Völgy-láz (Valley Fever)
Sok hőmérséklet-állandó állat kaphat völgy-lázat, de a kutyák a legfogékonyabbak. Ez a gombás betegség az USA déli részében és Mexikóban terjed. A fertőzés akkor történik, ha a kutya belehajtja a talajból származó spórákat. Ha az immunrendszer nem öli meg a gombát, a gomba-szervezetek a test minden részére eljutnak, elsősorban a csontokba és a szem szövetébe. A vadászi fajták a legsebezhetőbbek, de a házikutyák is kitévék a porviharok után. Tünetek: köhögés, légzési nehézség, depresszió, láz, csökkenett étvágy, lelassulás, testsúlycsökkenés, vakság.
Hisztoplazmózis
A Histoplasma capsulatum okozza a hisztoplazmózis gombás fertőzést. Az USA 31 államban él a talajban, és a tüdőn keresztül jut be a testbe. A hisztoplazmózis fertőzések általában a tüdőben kezdődnek, légúti problémákat okozva, mint köhögés vagy nehéz légzés. Ritkább esetekben szemfertőzés vagy occlus hisztoplazmózis szindróma jelentkezik. A hisztoplazmózis gyakran nem mutat nyilvánvaló tüneteket. Ha mégis, azok gyakran hasonlítanak a közönséges megfázás tüneteihez.
Kriptokokkózis
A Cryptococcus neoformans gomba okozza a kriptokokkózist. Bár széles körben elterjedt, ez a gomba verhatékonyan kevés kutyát fertőz meg. A legnagyobbr kockázatban az immunhiányos vagy immunsupprimált kutyák vannak. A kriptokokkózis el van izolva a talaj és a gyümölcsök gibi dolgoktól, de szorosan kapcsolódik a galamb trágyájához. A kutyák a gomba részecskék belehajtásával fertőznek meg, amelyek az orrkamrákban telepednek le. Bármilyen fajta fiatal kutya fertőzhetődik, de a cocker spánielnél némileg magasabb a gyakoriság. A kriptokokkózis széles körű tüneteket mutat, a fertőzött állatok nagy százalékában szem- vagy látásproblémák jelentkeznek.