A bagolyoknak két gyomra van, mindegyik más szerepet tölt be az emésztésben.
Az első gyomor, a proventriculus (glanduláris gyomor), tárolja az ételt és elkezdti bontani emésztősejtekkel. A második gyomor, a gizzard (izmagyomor), egy izmos szer, ami a bagoly által lenyelt kis kődarabok (gasztrolitok) segítségével őrli az ételt.
Ez a kétfázisú rendszer lehetővé teszi a hatékony emésztést, még ha az egészen lenyelt prédát is kezelik.