Igen, a fejsze sasoknak több természeti ragadozója van, beleértve más ragadozómadarak, nagy húszerő emlősök és néhány hüllő. Arany sasok, uhuk, havasi héjak és vörösfarkú héjak támadhatják a fejsze sasokat. Medvék, farkasok, kojotok és hegyiolok célba vehetik a tojásokat, csibéket vagy felnőtteket. Nagy kígyók és alligatorok a vízparti tojásokat és csibéket prédaalhatják.
Az emberi tevékenységgel kapcsolatos fenyegetések, mint az élőhely rombolás, vadászat és szennyezés azonban jelentősek. A védelmi erőfeszítések és jogi védelem kulcsfontosságú a fejsze sas populációk megőrzéséhez.