- colugo :Repülő lemurok néven is ismertek, ezek az emlősök egy patagium segítségével csúsznak a levegőben, egy membrán segítségével, amely végtagjaik között nyújt. A Fülöp -szigeteki Eagles étrendjük fő részeként célozza meg a Colugos -ot.
- Óriás repülő mókus :Ezek a nagy mókusok arboreális, fákban élnek. Egy másik élelmiszer -forrásként szolgálnak a Fülöp -szigeteki sasok számára.
- Fülöp -szigeteki makákó :Ez a fajta majom őshonos a Fülöp -szigeteken, és idejének nagy részét a fákban tölti, így kiszolgáltatottá válik a Fülöp -szigeteki Eagles ragadozása miatt.
- Egyéb emlősök :A Fülöp -szigeteki Eagles időnként vadászhat patkányokat, denevéreket és más, az erdőkben élő kis emlősöket.
Érdemes megjegyezni, hogy a Fülöp -szigeteki Eagles csúcs ragadozók, azaz az élelmiszerlánc tetején vannak, és nincsenek természetes ragadozók. Vadászati bátorságuk és erőteljes talonjuk lehetővé teszi számukra, hogy hatékonyan elfogják és megölik a zsákmányukat, így a világ egyik legfélelmetesebb ragadozó madárja.